合作协议中甲方分公司，未在甲方栏签字盖章，

合作协议问题，应首先确认双方真实意愿并协商处理。
若双方均认可协议内容，可补充签字盖章确认；若存在争议，应协商修改或解除协议。选择处理方式时，需考虑协议实际情况及双方利益，确保合法合规。
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合作协议效力需具体判断，未签字盖章或影响效力。
依据《合同法》，合同需双方真实意思表示且不违反法律规定才有效。若甲方分公司未签字盖章，可能表明其未同意协议，影响协议效力。若协议无效且未及时处理，可能导致双方权益受损，产生法律纠纷。
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协议效力需判断。
1. 若甲方分公司未签字盖章为疏忽，可与乙方协商，由甲方分公司补签或盖章，确保协议有效。
2. 若甲方分公司拒绝签字盖章，表明其不同意协议，应与乙方协商解除协议，避免后续纠纷。
3. 若协议内容存在违法情形，无论是否签字盖章，均应立即终止履行，并寻求法律途径解决。